В соответствии с п.3 Положения о подготовке и размещении в ЕИС отчета об исполнении контракта, утвержденного постановлением Правительства РФ от 28.11.2013 г. N 1093, отчет размещается в течение 7 рабочих дней со дня оплаты заказчиком обязательств и подписания заказчиком документа о приемке результатов исполнения контракта и (или) о результатах отдельного этапа его исполнения.
Таким образом, в случае получения заказчиком в рамках заключенного контракта товара по накладной подписание документа о приемке и его оплата или подписание документа о приемке выполненных работ, оказанных услуг и их оплата являются исполнением этапа по контракту и отражаются в отчете.
Документ: Письмо Минэкономразвития России от 13.05.2015 N Д28и-1341