Это условие, по мнению ФАС, не противоречит положениям Закона N 44-ФЗ. В акте приемки результатов исполнения контракта необходимо отразить общую сумму оплаты, размер неустойки, основания ее применения и порядок подсчета, а также итоговую сумму.
На правомерность оплаты контракта за вычетом неустойки указывает и Минэкономразвития.
Документ: Письмо ФАС России от 10.12.2015 N АЦ/70978/15